Собираюсь ехать работать за границу на 3 года по программе для врачей. Войдут мне эти три года во врачебный стаж?

Здравствуйте, Сергей.

Да. Только оформите официально Ваши трудовые отношения с тем лечебным учреждением, где Вы будуете работать. А по возвращении назад необходимо будет сделать официальный перевод документов.